当你在地热山谷拿到了亚特兰蒂斯地图后，别急着走，你需要重新回到那个观测站。在观测站的右侧，你会发现一条山脊，那里有一条滑索，顺着滑索垂直下降到底部，你会看到一扇挡路的木门，用爆炸物比如榴弹箭或者附近能找到的希腊火罐子把它炸开，就能进入被淹没的档案室区域的入口了。进去迎接你的首先是一场战斗，大厅里会有重甲兵出现，不过场景里摆放了不少希腊火罐子，利用这些罐子可以有效杀伤敌人，比如可以先用手头的罐子或者弓箭引爆两个罐子快速清理掉他们。为了节省弹药，你还可以捡起地上的瓶瓶罐罐扔出去吸引敌人聚拢，再一并用爆炸解决，这样效率会高很多。
我们的核心目标是用希腊火炸毁支撑巨大雕像的三处基座，让雕像倒塌形成通路。第一处爆破点比较简单，进入大厅后就能看到，支座旁边通常就有现成的希腊火罐子，直接开枪引爆它们就能炸毁第一个支撑点。接下来需要寻找第二个罐子，你需要游泳到水池对岸，沿着瀑布和河道往里走，会找到一个闸门，用弓箭拉开闸门可以释放出漂浮的希腊火罐。第一个放出的罐子主要用于清理河道中的障碍物，让它漂到障碍处引爆开路。你需要切换到河道的左岸，再次拉开闸门放出第二个罐子，这个罐子才是关键。当它漂过第一个已被清除的障碍后，你得迅速使用套索箭，射击罐子并将其与岸边的一个木桩连接起来，这样罐子的漂流方向就会被改变，朝岸边靠拢，这时再割断连接罐子的绳索，罐子就会顺着水流转弯，沿着障碍物之间的缝隙继续漂流，最终漂到第二个雕像支座附近，抓住时机开枪引爆即可。
搞定两处之后，就剩最后一个也是最复杂的一处了。你需要继续前进，会发现另一个装有希腊火罐的闸门和一个巨大的天平机关。操作顺序需要些耐心：站在闸门前，用弓箭射击天平一端的摇臂，这样可以把那根长长的摇臂转动并拉到你面前。打开闸门放出一个希腊火罐，然后站到罐子旁边，再次用弓箭射击刚才拉过来的摇臂，就能用绳索把罐子绑在摇臂的这一头。绑上重物后，天平这一侧会因为重量而下沉。之后，你需要如法炮制，去操作天平的另一端：先把另一侧的摇臂也用同样的方法拉到面前，然后打开闸门放出第二个罐子（如果闸门只能开一次，通常附近会有现成可用的罐子），将其绑定在这一侧的摇臂上。这样两端都挂上重量相当的火罐后，天平就会恢复平衡状态。
完成绑定后，你需要走到水池的另一边，再次转动天平机关。这次转动会让绑着第一个希腊火罐的那段摇臂转向对岸，并将其运送过去。当罐子被送到合适位置后，看准机会割断绑着它的绳索，罐子会掉下来。然后你需要将掉落的罐子踢进墙壁上的一个缺口凹槽里，罐子会顺着这个设计好的通道滚落下去，掉进下方的水流中。它会顺流而下，一直漂到最后一个雕像支座的旁边，这时抓住机会开枪将其引爆。成功引爆后，最后一个支撑点被破坏，巨大的雕像便会轰然倒塌，向前倾斜，恰好搭成一座通往出口的桥梁。雕像倒塌形成通路后，剧情会强制进入一段紧张刺激的逃亡环节。不死军团的追兵会突然出现，你需要立刻开始快速跑酷逃离档案室。这段路需要一气呵成，攀爬和跳跃不能有太多迟疑，因为身后会有敌人发射火箭，场景中也可能有零散的希腊火罐，要尽量避开防止被误伤。沿着既定的路线不断向上攀爬，利用钩斧荡过断崖，穿过火焰燃烧的墙洞，顺着墙外的壁架移动，最终可以逃离这个危险区域。
