元气骑士的任务系统是游戏核心玩法之一，任务主要分为悬赏任务和挑战任务两种类型。悬赏任务需要在地牢中击杀特定怪物获取奖励，挑战任务则需携带特定因子通关。任务板位于客厅左上角，每天随机刷新1-2个悬赏任务，完成后方可领取宝石、材料等奖励。警官NPC负责发放任务，挑战因子会带来增益或减益效果，需谨慎选择适合当前角色和武器搭配的因子组合。
日常任务系统包含九种基础类型，包括讨伐魔物、修复雕像、夺取骑士徽章等。讨伐魔物只需击败最终BOSS即可完成，期间可无视小怪直接冲刺BOSS房间。被破坏的雕像任务需在指定地图层数寻找三个碎片，地图中感叹号标记即为碎片位置，拾取后会刷新小怪，集齐碎片后与神像交互将触发精英怪战斗。夺取骑士徽章任务要求击败带有感叹号标记的精英怪，集齐四个徽章才算完成。
任务刷新机制具有明确规则，必须完成当前挑战任务才能刷新新任务。每日任务数量存在上限，未完成任务将保留至次日刷新。对于难度过高或不符合当前装备的任务，可通过有限次数的刷新功能更换。秋梨村的骑士团成员偶尔会提供额外支线任务，这类任务通常以感叹号标记，完成后可获得角色卡片等特殊奖励。
高阶任务如邪王的迷阵世界具有特殊机制，威压等级会随关卡推进逐渐提升，导致怪物血量和韧性增长。该模式下可通过机械师购买全息炮台等防御建筑，炮台可更换武器内核增强战力。神殿任务帮助太郎找到主人需要先解救牢笼中的忠犬太郎，随后向下层房间清理怪物，主人会自动现身。部分赛季任务涉及芯片收集，可通过击败燃料房BOSS或赛季商店获取。
任务与角色培养存在深度关联，完成指定任务可解锁恶魔术士二技能等特殊能力，这些技能碎片需击败机械皇后等BOSS概率掉落。职业混合玩法达到5级后开启，将两种基础职业结合产生新职业，例如风暴术士与盗贼组合为风暴刺客。任务奖励的装备品质分为五阶，金色传说品质建议优先收集，装备羁绊需要两件以上套装激活。
